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本發明公開了經過遺傳改造的紫色桿菌素生物合成基因簇、重組表達載體、工程菌及其應用，通過對紫色桿菌素生物合成基因簇的核糖體結合位點進行定點突變和密碼子缺失突變改造，促進紫色桿菌素合成蛋白的有效翻譯，獲得生產潛力顯著提高的改造基因簇；通過將上述改造基因簇或者含有改造基因簇的重組載體導入到宿主菌，獲得了高產紫色桿菌素的工程菌；進一步對工程菌的發酵條件進行了優化并提供紫色桿菌素的分離純化方法。本發明構建的基因工程菌株不僅能夠顯著提高紫色桿菌素的產量，且與常規的紫色桿菌素20℃或25℃低溫發酵不同，在25?37℃的溫度條件下均可高效生產紫色桿菌素代謝產物，解決了發酵過程中的降溫成本高的問題，適用于規模化生產。

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